Primero deberías descargar el sistema operativo...lo del cubo 3D y todo eso viene después.
En realidad Ubuntu es una distribución de GNU/Linux un sistema operativo, y este efecto de escritorio que viste (Beryl) lo podés instalar en casi cualquier distribución. Hay muchas distribuciones Linux.
A diferencia de Windows donde la interfaz gráfica esta unida al kernel, en GNU/Linux tenés por una parte:
Kernel (Propiamente lo que es linux, un kernel o núcleo de sistema)
Aplicaciones: librerías, aplicaciones de consola, aplicaciones gráficas, archivos de sistema, etc etc etc.
Interfaz Gráfica: Las mas usuales Gnome y KDE (Pero hay muchas más, podés chequearlas
aquí.
Esta modularidad te permite tener un sistema operativo mucho más funcional. Por ejemplo si estuviste un mes usando la interfaz gráfica GNOME y querés pasarte a otra, por ejemplo KDE podés instalarla. Y en cada inicio de sesión podés elegir utilizar GNOME o KDE.
Ahora, vayamos a tu pregunta, de donde descargar el sistema operativo Ubuntu:
http://www.ubuntu.com/getubuntu/download
La última versión estable es la 7.04 y es la que deberías descargar. Esto te va a bajar una imagen (.iso) con el sistema operativo que tienes que quemar a un CD.
El proceso de instalación:
Bueno, este es un paso muy largo pero ya alguien se ha encargado de explicarlo en
su sitio web. 
.
Bueno, espero que te haya servido y te animes a instalarlo. Y cualquier duda que tengas en el proceso de instalación o si tenés problema con tu disco externo no dudes en consultarnos.